Super levure mortelle trouvée dans la nature pour la première fois

Une souche de Candida auris cultivée dans une boîte de Pétri dans un laboratoire du CDC.

Une levure de superbactérie effrayante qui tue des gens dans les hôpitaux peut également survivre très bien en dehors d'eux, selon une nouvelle étude publiée mardi. Pour la première fois, des chercheurs affirment avoir découvert des souches multirésistantes du champignon Candida auris dans un environnement naturel, dans les zones humides reculées de l'Inde. Les résultats indiquent que ces types d'environnements pourraient être la maison natale de la levure, tout en fournissant également des preuves que le réchauffement des températures dû au changement climatique a récemment rendu le champignon dangereux pour les humains, comme certains scientifiques l'ont théorisé.

C. auris a été découvert pour la première fois en 2009 par des médecins japonais, qui l'ont isolé d'une infection de l'oreille d'un patient (les premiers cas connus remontent cependant au milieu des années 1990). Depuis lors, la levure a été trouvée dans plus d'une douzaine de pays, y compris les États-Unis. Elle peut provoquer des infections potentiellement mortelles, en particulier chez des patients hospitalisés déjà affaiblis. Mais ce qui rend la levure particulièrement effrayante, c'est qu'elle résiste souvent à plusieurs médicaments antifongiques à la fois, ce qui rend ces infections difficiles à traiter et souvent mortelles . Le champignon est également un survivant en dehors du corps humain, donc une fois qu'il est établi quelque part, il est incroyablement difficile de le retirer de l'environnement. Si cela ne suffisait pas,C. auris ne peut pas être identifié facilement par les tests conventionnels, ce qui peut retarder les soins et augmenter le risque de décès.

Il n'y a eu qu'environ 1600 cas d'infection à levures identifiés aux États-Unis depuis 2009, mais elle est considérée comme l'une des menaces germinales émergentes les plus graves auxquelles nous sommes confrontés aujourd'hui. Cette menace a rendu la compréhension de ses origines et de sa probable introduction récente aux gens d'autant plus importantes. Cette nouvelle étude, publiée mardi dans mBio, semble fournir les premiers véritables indices de ce mystère.

Des chercheurs en Inde et au Canada ont cherché dans des niches environnementales de l'Inde largement isolées des humains qui auraient pu être habitables pour la levure, sur la base de sa biologie connue et de celle des espèces apparentées. Ils ont prélevé des échantillons de sol et d'eau dans les zones humides côtières des îles Andaman, un archipel non loin du continent. Dans deux des huit sites qu'ils ont recherchés - un marais salé et une plage de sable - ils ont trouvé le champignon. L'équipe a trouvé des souches de C. auris qui étaient sensibles et résistantes aux antifongiques, et ces souches présentaient une ressemblance génétique étroite avec les souches recueillies auprès de patients en Inde.

Dans l'ensemble, leurs travaux sur C. auris suggèrent que «avant sa reconnaissance en tant que pathogène humain, il existait en tant que champignon environnemental», ont écrit les auteurs.

Comparé à d'autres espèces de Candida , C. auris est connu pour se développer particulièrement bien dans des températures plus chaudes. Cela a amené certains chercheurs à se demander si le changement climatique avait joué un rôle dans son émergence en tant que germe humain. La théorie soutient que les changements du climat dans leur environnement naturel ont amené la levure à s'adapter légèrement et à devenir encore plus tolérante aux températures plus chaudes - le type exact de températures qui ferait des humains et d'autres mammifères une maison confortable une fois que la levure a commencé à entrer régulièrement en contact. avec nous.

Les nouvelles découvertes semblent ajouter plus de poids à cette théorie. En plus de montrer que ces champignons peuvent vivre et vivent loin des gens, l'équipe a trouvé des différences subtiles entre les échantillons trouvés. Une souche de levure trouvée dans la marche du sel plus éloignée a été plus lente à se développer sous des températures plus chaudes que les souches trouvées sur la plage de sable et une autre souche de la marche du sel; cette souche était également la seule à être sensible aux antifongiques courants et moins étroitement liée aux souches observées chez l'homme. Pendant ce temps, les autres souches étaient toutes résistantes aux antifongiques et plus aimant la chaleur. Les souches trouvées sur la plage, où les gens se rendent parfois, auraient pu être réintroduites dans l'environnement par l'homme, ce qui pourrait expliquer pourquoi elles étaient plus étroitement liées aux souches trouvées chez les patients.

Il est possible que les chercheurs aient essentiellement collecté des instantanés du parcours évolutif de la levure, avant et après le changement climatique a commencé à modifier leur biologie et ils ont d'abord infecté des personnes. Dans un commentaire d' accompagnement rédigé par certains des chercheurs qui ont proposé cette théorie pour la première fois - Arturo Casadevall de Johns Hopkins, Dimitrios Kontoyiannis de l'Université du Texas MD Anderson Cancer Center et Vincent Robert du Westerdijk Fungal Biodiversity Institute aux Pays-Bas - ils étaient d'accord avec ces conclusions.

«Cette découverte historique est cruciale pour comprendre l'épidémiologie, l'écologie et l'émergence de C. auris en tant que pathogène humain», ont-ils écrit.

Dans une déclaration publiée par l'American Society For Microbiology, qui publie mBio, l'auteur principal Anuradha Chowdhary, mycobiologiste médical à l'Université de Delhi en Inde, a déclaré: «Cette étude constitue le premier pas vers la compréhension de la façon dont ce pathogène survit dans les zones humides. , mais ce n’est qu’un créneau. »

Les résultats ne valent encore qu'une seule étude, ils ne prouvent donc pas à eux seuls que le changement climatique a introduit ce dernier cauchemar dans nos vies, ce que les auteurs reconnaissent. Et il reste encore beaucoup à résoudre sur la manière et à partir de l'endroit où C. auris a émergé de la nature et dans nos hôpitaux, sans mentionner s'il y a quelque chose qui peut être fait pour arrêter sa propagation.

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